Фильм «Доктор Стоун: Рюсуй» продолжает захватывающую историю Сэнку Исигами, который стремится разгадать тайну зелёного света, превратившего человечество в камень. С помощью бывших союзников Цукасы, он строит корабль для дальнейших исследований, но для успешного плавания необходим капитан. В поисках подходящего кандидата, Сэнку и его команда находят окаменевшего Рюсуя Нанами — наследника мощного морского конгломерата. Хотя Рюсуй был не самым приятным человеком при жизни, его обширные знания о парусниках могут стать решающим фактором для их миссии. Сэнку принимает рискованное решение воскресить Рюсуя, надеясь, что его опыт поможет добиться успеха в их приключении.